USB универсальнее, далеко не всем нужен внешний накопитель. А если нужен - отдельно ставится мост USB-SATA и там уж разница скорости интерфейса между 500 и 600 МБ/с при, в общем-то, скромном процессоре совершенно не видна на реальном накопителе, будь то HDD или SSD.
А так же, RPi - это не самый интересный (в смысли упакованности) микрокомпьютер, есть куча других, нашпигованных любой периферией. Но несколько дороже исходных $35 и, что заметно для "чайников", с меньшим количество готовых ответов на проблемы. Достоинство RPi именно в большой распространенности - больше проблем уже выявлено, больше сценариев применения испытано, для промышленных применений гарантируется доступность на протяжении указанных сроков. А то вон если взять OrangePi - и дешевле, и вай-фай давно на борту, но то тут дрова сырые, тут несовместимая распиновка, тут сборка с древним ядром линукса, тут вот прикольно все, но автору прошивки надоело и он забил ее поддерживать. Для творческого развития себя как хакера, конечно, это благотворно. Но иногда это бесит, когда надо просто запустить ранее уже отлаженное приложение.
Вот тут популярные альтернативы есть -
https://www.maketecheasier.com/raspberry-pi-alternatives/